Obstaja veliko vrst dokazi, ki podpirajo evolucijo, vključno s študijami na področju molekularne biologije, kot so DNK, in v razvojna biologija polje. Vendar so najpogosteje uporabljene vrste dokazov za evolucijo anatomske primerjave med vrstami. Medtem homologne strukture pokažejo, kako so se podobne vrste spremenile od starih prednikov, analogne strukture kažejo, kako so se razvile različne vrste, da bi postale bolj podobne.
Specifikacija
Specifikacija je sčasoma sprememba ene vrste v novo vrsto. Zakaj bi različne vrste postale bolj podobne? Običajno je vzrok za konvergentna evolucija je podoben izbirni pritisk v okolju. Z drugimi besedami, okolja, v katerih živijo dve različni vrsti, so podobna in te vrste morajo zapolniti enako niša na različnih območjih po svetu.
Od naravna selekcija deluje enako v teh okoljih, iste vrste prilagoditev so ugodne, posamezniki z ugodnimi prilagoditvami pa preživijo dovolj dolgo, da prenesejo svoje gene na potomce. To se nadaljuje, dokler v populaciji ne ostanejo samo posamezniki z ugodnimi prilagoditvami.
Včasih lahko tovrstne prilagoditve spremenijo strukturo posameznika. Karoserijske dele je mogoče pridobiti, izgubiti ali preurediti glede na to, ali je njihova funkcija enaka prvotni funkciji tega dela. To lahko privede do podobnih struktur pri različnih vrstah, ki na različnih lokacijah zasedajo isto vrsto niše in okolja.
Taksonomija
Kdaj Karolus Linnej najprej začeli razvrščati in poimenovati vrste s taksonomija, znanost o klasifikaciji, je pogosto združeval podobne vrste v podobne skupine. To je privedlo do napačnih skupin v primerjavi z evolucijskim poreklom vrste. Ker vrste izgledajo ali se obnašajo enako, še ne pomeni, da so tesno povezane.
Analognim strukturam ni treba imeti iste evolucijske poti. Ena analogna struktura je morda nastala že zdavnaj, medtem ko je analogna ujema z drugimi vrstami morda razmeroma nova. Lahko so skozi različne razvojne in funkcionalne faze, preden si povsem podobni.
Analogne strukture niso nujno dokaz, da sta dve vrsti izhajali iz skupnega prednika. Bolj verjetno je, da prihajajo iz dveh ločenih vej filogenetskega drevesa in morda sploh niso tesno povezani.
Primeri
Človeško oko je po zgradbi zelo podobno očesu hobotnica. Pravzaprav je oko hobotnice boljše od človeškega, saj nima "slepe točke". V strukturi je to edina razlika med očmi. Vendar hobotnica in človek nista tesno povezana in prebivata daleč drug od drugega na filogenetskem drevesu življenja.
Krila so priljubljena priredba mnogih živali. Netopirji, ptice, žuželke in pterozavri vsi so imeli krila. Toda netopir je bolj povezan s človekom kot s ptico ali žuželko, ki temelji na homolognih strukturah. Čeprav imajo vse te vrste krila in lahko letijo, se na druge načine zelo razlikujejo. Pravkar napolnijo letečo nišo na svojih lokacijah.
Morski psi in delfini so videti zelo podobni zaradi barve, postavitve plavuti in celotne oblike telesa. Vendar so morski psi ribe, delfini pa sesalci. To pomeni, da so delfini v evolucijski lestvici bolj povezani s podganami, kot so morski psi. To so dokazale tudi druge vrste evolucijskih dokazov, kot so podobnosti DNK.
Določiti je treba več kot videz, katere vrste so tesno povezane in katere so se razvile od različnih prednikov, da bi postale bolj podobne po svojih analognih strukturah. Vendar so analogne strukture same po sebi dokaz za teorijo naravne selekcije in kopičenja prilagoditev sčasoma.