Večji del prazgodovine je bila Južna Karolina geološka slepa meja: to državo so večino paleozojske in mezozojske dobe prekrivali plitki oceani, pa tudi veliki kosi kenozoika. Zaključek je, da v zvezni državi Palmetto še nikoli niso odkrili nedotaknjenih dinozavrov, Južna Karolina ima bogat fosilni zapis o morju vretenčarji, kot so kiti, krokodili in ribe, pa tudi zdrava vrsta megafavnskih sesalcev, o čemer lahko izvedete z vpogledom v naslednje diapozitivi.
Južna Karolina je ležala v celoti pod vodo Triasno in Jurski obdobja, vendar so različne regije uspele ostati visoke in suhe med raztezki Kredain so bile nedvomno naseljene z različnimi vrstami dinozavrov. Na žalost so paleontologi uspeli odkriti le raztresene fosile: nekaj zob, ki pripadajo a hadrosavra, prstna kost, ki pripada a raptor, in drugi razdrobljeni ostanki, ki so jih pripisali neidentificiranemu rodu tepodic (dinozavra, ki jedo meso).
Danes je aligatorji in krokodili južne ZDA so večinoma omejene na Florido - vendar to pred milijoni let v času ZDA ni bilo tako
Kenozojska doba, ko so se prazgodovinski predniki teh zobatoga plazilca gibali gor in dol po vzhodni obali. Amaterski zbiralci fosilov so odkrili raztresene kosti številnih krokodilov iz Južne Karoline; na žalost je večina teh najdb tako fragmentarnih, da jih ni mogoče pripisati nobenemu točno določenemu rodu.Fosilizirane ribe so pogosta najdba v geoloških usedlinah Južne Karoline; kot je to pri krokodilih, je pogosto mogoče težko pripisati teh fosilov določenemu rodu. Ena izjema je razmeroma prikrit Xiphiorhynchus, prazgodovinska mečarica iz obdobja Eocen epohi (pred približno 50 milijoni let). Kar se tiče kiti, med sorazmerno obskurnimi rodovi, ki so pred milijoni let brskali po obalnem pasu države Palmetto, so bili Eomysticetus, Micromysticetus in primerno imenovan Carolinacetus.
Problematična zgodovina suženjstva v Južni Karolini vpliva celo na paleontologijo te države. Leta 1725 so se lastniki nasadov posmehovali, ko so njihovi sužnji nekatere fosilizirane zobe razlagali kot pripadnost a prazgodovinski slon (seveda bi te sužnje poznali sloni iz svojih matičnih držav v Afriki). Ti zobje so, kot se je izkazalo, pustili mimo Volneni mamuti, ker naj bi nadstandardni vozniki sužnjev predvidevali, da so jih zapustili biblijski "velikani", utopljeni v Veliki poplavi!
Kamnolom Giant Cement v bližini Harleyville-a je v poznem obdobju ustvaril fosilni posnetek zemeljskega življenja. Pleistocen Južna Karolina, pred približno 400.000 leti. Najbolj znani megafaunski sesalec, odkrit tukaj, je Smilodon, bolj znan kot Sabljastega tigra; drugi rodovi vključujejo Ameriški gepar, the Velikanski lenob, različne veverice, zajci in rakuni ter celo lame in tapirji, ki so izumrli iz Severne Amerike na vrhuncu moderne dobe.