Aminokisline so vrsta organske kisline, ki vsebuje karboksilno skupino (COOH) in amino skupino (NH2). Splošna formula aminokisline je podana spodaj. Čeprav je nevtralno nabita struktura običajno napisana, je netočna, ker ima kisli COOH in bazični NH2 skupine med seboj reagirajo in tvorijo notranjo sol, imenovano zwitterion. Zwitterion nima neto naboja; obstaja ena negativna (COO-) in eno pozitivno (NH3+) napolniti.
Iz tega izhaja 20 aminokislin beljakovine. Medtem ko obstaja več načinov za njihovo razvrščanje, je ena najpogostejših takih, da jih razvrstimo glede na naravo stranskih verig.
Osem jih je amino kisline z nepolarnimi stranskimi verigami. Glicin, alanin in prolin imajo majhne nepolarne stranske verige in so vse zelo hidrofobne. Fenilalanin, valin, levcin, izolevcin in metionin imajo večje stranske verige in so močneje hidrofobne.
Obstaja tudi osem aminokislin s polarnimi, nepolnjenimi stranskimi verigami. Serin in treonin imata hidroksilne skupine. Asparagin in glutamin imata amidne skupine. Histidin in triptofan imata heterociklične aromatske aminske stranske verige. Cistein ima sulfhidrilno skupino. Tirozin ima fenolno stransko verigo. Sulfhidrilna skupina cisteina, fenolna hidroksilna skupina tirozina in imidazolna skupina histidina kažejo določeno stopnjo pH-odvisnosti ionizacije.
Obstajajo štiri aminokisline z napolnjenimi stranskimi verigami. Aspartinska kislina in glutaminska kislina imajo na svojih stranskih verigah karboksilne skupine. Vsaka kislina je pri pH 7,4 popolnoma ionizirana. Arginin in lizin imata stranske verige z amino skupinami. Njihove stranske verige so v celoti protonirane pri pH 7,4.