Vakuola je a celična organela najdemo v številnih različnih vrstah celic. Vakuole so zaprte strukture, ki so napolnjene s tekočino in so ločene od citoplazma z eno samo membrano. Najdemo jih večinoma v rastlinske celice in glive. Vendar pa nekateri protestniki, živalskih celic, in bakterije vsebujejo tudi vakuole. Vakuole so odgovorne za najrazličnejše pomembne funkcije v celici, vključno s shranjevanjem hranil, razstrupljanjem in izvozom odpadkov.
Rastlinsko celično vakuolo obdaja ena sama membrana, imenovana tonoplast. Vakuole nastanejo, ko se vezikle sprostijo Endoplazemski retikulum in Kompleks Golgi, združi se skupaj. Novonastale rastlinske celice običajno vsebujejo več manjših vakuolov. Z zorenjem celice nastane velika fuzija srednjih vakuolov, ki nastanejo iz zlivanja manjših vakuolov. Osrednja vakuola lahko zasede do 90% volumna celice.
Rastlinske vakuole delujejo podobno kot v rastlinah lizosomi v živalskih celicah. Lizosomi so membranski vrečki encimov, ki prebavijo celične makromolekule. Pri njem sodelujejo tudi vakuoli in lizosomi
programirana celična smrt. Programirana celična smrt v rastlinah nastopi s procesom, imenovanim avtoliza (samodejna liza). Avtoliza rastlin je naravni proces, pri katerem rastlinsko celico uničijo lastni encimi. V urejenem nizu dogodkov se vakuolski tonoplast poruši, tako da se njegova vsebina sprosti v celično citoplazmo. Prebavni encimi iz vakuole nato razgradijo celotno celico.