Nekatere organizacije so morda povezane z osrednjo skupino Osame bin Ladena. Vse bolj pa skupine, ki se zavezujejo pripadnosti Al Kaidi, nimajo nobene formalne povezave.
Medtem ko mnogi analitiki uporabljajo metaforo trženja, da Al Kaido opisujejo kot "blagovno znamko", njene izvide pa kot "franšize", drugi opisujejo pojav decentralizacije v smislu osnovne skupine strokovnjaki, obkrožen z novim članstvom v „navadnih“ podružnicah.
Kot je dejal analitik Adam Elkus, je ta decentralizacija posledica strategije, ne nesreča. Leta 2007 je napisal, da:
Al Kaida že od invazije na Afganistan napreduje k decentralizaciji, z izoliranimi celicami in ohlapno povezanimi skupinami, ki so le neznatno povezane z večja hierarhija Al Kaide, ki se uporablja za nekatere od teh "knock-off" skupin, izvira iz že obstoječih militantnih skupin, ki so se zavezale za neko različico islamistične preobrazbe njihove družbe. Na primer, v Alžiriji je Al Kaida v islamskem Magrebu nova inkarnacija druge skupine, salafista Skupina za klic in boj, ki se je dolgo in nasilno zavezala strmoglavljanju Alžircev vlada. Nenadno zavzetost skupine za globalni džihad v slogu Al Kaide je treba sprejeti z zrnom soli ali vsaj preučiti glede na njegovo lokalno zgodovino.