Opredelitev in primeri RNA

RNA je akronim za ribonukleinsko kislino. Ribonukleinska kislina je a biopolimer uporablja se za kodiranje, dekodiranje, urejanje in izražanje geni. Oblike RNA vključujejo messenger RNA (mRNA), prenos RNA (tRNA) in ribosomal RNA (rRNA). RNA kode za aminokislina sekvence, ki jih lahko združimo v tvorbo beljakovine. Kadar se uporablja DNK, RNA deluje kot posrednik in prepisuje kodo DNK, tako da se lahko prevede v beljakovine.

RNA je sestavljena iz nukleotidov, ki so narejeni iz sladkorja riboze. Ogljikovi atomi v sladkorju so oštevilčeni od 1 do 5 '. Na 1 'ogljik sladkorja je pritrjen purin (adenin ali gvanin) ali pirimidin (uracil ali citozin). Kljub temu, da RNA prepisujemo z uporabo le teh štirih baz, jih pogosto spremenimo, da dobimo več kot 100 drugih baz. Sem spadajo psevouridin (Ψ), ribothymidin (T, ki ga v DNK ne zamenjamo s T za timin), hipoksantin in inozin (I). Fosfatna skupina, vezana na 3 'ogljik ene molekule riboze, se veže na 5' ogljika naslednje molekule riboze. Ker fosfatne skupine na molekuli ribonukleinske kisline nosijo negativne naboje, je RNA tudi električno napolnjena. Vodikove vezi se tvorijo med adeninom in uracilom, gvaninom in citozinom ter tudi gvaninom in uracilom. Te vodikove vezi tvorijo strukturne domene, kot so zanke las, notranje zanke in izbokline.

Oboje RNA in DNK so nukleinska kislina, vendar RNA uporablja monosaharidno ribozo, medtem ko DNK temelji na sladkorni 2'-deoksiribozi. Ker ima RNA na svojem sladkorju dodatno hidroksilno skupino, je labilnejša od DNK, z nižjo energijo aktivacije hidrolize. RNA uporablja dušikove baze adenin, uracil, gvanin in timin, medtem ko DNK uporablja adenin, timin, gvanin in timin. Prav tako je RNA pogosto enoverižna molekula, DNK pa dvotirna vijačnica. Vendar molekula ribonukleinske kisline pogosto vsebuje kratke odseke vijačnic, ki molekulo zložijo vase. Ta pakirana struktura daje RNA sposobnost, da služi kot katalizator na skoraj enak način, saj lahko beljakovine delujejo kot encimi. RNA je pogosto sestavljena iz krajših nukleotidnih verig kot DNK.

Obstajajo 3 glavne vrste RNA:

• Messenger RNA ali mRNA: mRNA prinaša informacije iz DNK v ribosome, kjer se prevede, da nastanejo beljakovine za celico. Šteje se za kodiranje vrste RNA. Vsaki trije nukleotidi tvorijo kodon za eno aminokislino. Ko se aminokisline povežejo in so spremenjene po prevajanju, je rezultat protein.
• Prenesite RNA ali tRNA: tRNA je kratka veriga z okoli 80 nukleotidom, ki prenaša novo nastalo aminokislino na konec rastoče polipeptidne verige. Molekula tRNA ima antikodon odsek, ki prepozna moda aminokislin na mRNA. Na molekuli so tudi mesta pritrditve aminokislin.
• Ribosomska RNA ali rRNA: rRNA je druga vrsta RNA, ki je povezana z ribosomi. Obstajajo štiri vrste rRNA pri ljudeh in drugih evkariotih: 5S, 5.8S, 18S in 28S. rRNA se sintetizira v nukleolusu in citoplazmi celice. rRNA se kombinira z beljakovinami, da tvori ribosom v citoplazmi. Ribosomi nato vežejo mRNA in izvajajo sintezo beljakovin.

Poleg mRNA, tRNA in rRNA obstaja v organizmi še veliko drugih vrst ribonukleinske kisline. Eden od načinov za njihovo kategorizacijo je po njihovi vlogi pri sintezi beljakovin, podvajanju DNK in post-transkripcijskemu spreminjanju, uravnavanju genov ali parazitizmu. Nekatere od drugih vrst RNA vključujejo:

• RNA ali tmRNA za prenosno sporočilo: tmRNA najdemo v bakterijah in ponovno zažene zastane ribosome.
• Majhna jedrska RNA ali snRNA: snRNA najdemo v evkariotih in arhejah in deluje pri spajanju.
• Sestavni del RNA telomeraze ali TERC: TERC najdemo v evkariotih in deluje v sintezi telomerov.
• Enhancer RNA ali eRNA: eRNA je del genske regulacije.
• Retrotransposon: Retrotransposoni so vrsta samorazmnoževalne parazitske RNA.

• Barciszewski, J.; Frederic, B.; Clark, C. (1999). RNA biokemija in biotehnologija. Springer. ISBN 978-0-7923-5862-6.
• Berg, J.M.; Tymoczko, J.L.; Stryer, L. (2002). Biokemija (5. izd.). WH Freeman in družba. ISBN 978-0-7167-4684-3.
• Cooper, G.C.; Hausman, R.E. (2004). Celica: Molekularni pristop (3. izd.). Sinauer. ISBN 978-0-87893-214-6.
• Söll, D.; RajBhandary, U. (1995). tRNA: struktura, biosinteza in delovanje. ASM Pritisnite. ISBN 978-1-55581-073-3.
• Tinoco, I.; Bustamante, C (Oktober 1999). "Kako se RNA zloži". Časopis za molekularno biologijo. 293 (2): 271–81. doi: 10.1006 / jmbi.1999.3001